Il battistero è stato edificato dopo il 1516 sulle fondamenta di una precedente chiesa dedicata a San Martino.
In seguito all’abbattimento dell’antico Battistero attuato nel 1555 per ampliare la piazza di fronte alla nuova facciata del duomo, ne assunse il titolo e la funzione.
Dopo il terremoto del 1873, che comportò la demolizione della vicina chiesa di S. Andrea, ne ospita la trecentesca Madonna delle Grazie, mentre le sue numerose tavolette ex-voto (dal XV al XIX secolo) sono conservate al Museo Civico.
All’interno, a coronamento della grande vasca battesimale, un piccolo San Giovanni Battista opera di Andrea Brustolon (1662-1732).
